Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHAF1AQ13111 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CHAF1AQ13111 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHAF1AQ13111 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CHAF1AQ13111 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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