Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GPS1Q13098 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GPS1Q13098 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GPS1Q13098 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GPS1Q13098 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.1 ms