Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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TMEM260Q9NX78 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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TMEM260Q9NX78 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMEM260Q9NX78 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
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TMEM260Q9NX78 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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TMEM260Q9NX78 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
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TMEM260Q9NX78 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TMEM260Q9NX78 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMEM260Q9NX78 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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