Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LINC00612Q8N6U2 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225 ms