Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DSC3Q14574 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DSC3Q14574 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
DSC3Q14574 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms