Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SCN5AQ14524 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN5AQ14524 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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