Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
IRF5Q13568 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
IRF5Q13568 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF5Q13568 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IRF5Q13568 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IRF5Q13568 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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