Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HDAC1Q13547 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
HDAC1Q13547 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
HDAC1Q13547 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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