Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SQSTM1Q13501 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SQSTM1Q13501 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SQSTM1Q13501 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SQSTM1Q13501 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SQSTM1Q13501 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SQSTM1Q13501 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SQSTM1Q13501 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SQSTM1Q13501 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SQSTM1Q13501 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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SQSTM1Q13501 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SQSTM1Q13501 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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