Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RAB40BQ12829 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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RAB40BQ12829 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RAB40BQ12829 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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RAB40BQ12829 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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RAB40BQ12829 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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RAB40BQ12829 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RAB40BQ12829 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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