Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RABGGTBP53611 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
RABGGTBP53611 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RABGGTBP53611 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RABGGTBP53611 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 473.7 ms