Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
USP53Q70EK8 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP53Q70EK8 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
USP53Q70EK8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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USP53Q70EK8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USP53Q70EK8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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USP53Q70EK8 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP53Q70EK8 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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USP53Q70EK8 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP53Q70EK8 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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USP53Q70EK8 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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USP53Q70EK8 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP53Q70EK8 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP53Q70EK8 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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USP53Q70EK8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP53Q70EK8 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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