Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.15□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-3.15□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
UBR3Q6ZT12 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-3.16□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-3.23□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
UBR3Q6ZT12 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.2 ms