Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CCDC142Q17RM4 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CCDC142Q17RM4 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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