Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
DDB1Q16531 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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DDB1Q16531 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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DDB1Q16531 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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DDB1Q16531 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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DDB1Q16531 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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DDB1Q16531 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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DDB1Q16531 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DDB1Q16531 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDB1Q16531 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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