Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-3.24□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SMCO1Q147U7 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-3.3□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-3.33□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SMCO1Q147U7 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
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