Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN4PQ13434 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
MKRN4PQ13434 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
MKRN4PQ13434 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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