Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SEMA3FQ13275 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEMA3FQ13275 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3FQ13275 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms