Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
GTF3C1Q12789 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms