Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPRDP23468 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPRDP23468 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
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