Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC142Q17RM4 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.1 ms