Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
RNPS1Q15287 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RNPS1Q15287 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RNPS1Q15287 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199 ms