Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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COL9A2Q14055 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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COL9A2Q14055 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
COL9A2Q14055 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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COL9A2Q14055 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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