Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHRNEQ04844 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHRNEQ04844 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.8 ms