Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRBP23467 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRBP23467 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.8 ms