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Protein–RNA interactions for Protein: O43236
SEPT4, Septin-4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEPT4
O43236
Y_RNA.423-201
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113 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
AC068339.1-201
ENST00000526965
141 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
MIR4752-201
ENST00000579672
72 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
AC067863.3-201
ENST00000624172
122 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
RNU6-524P-201
ENST00000384270
107 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
AC008267.6-201
ENST00000441664
139 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
MIR577-201
ENST00000385196
96 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
MIR519A1-201
ENST00000385257
85 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
MIR3910-1-201
ENST00000580936
111 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
SEPT4
O43236
Y_RNA.57-201
ENST00000362806
113 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-1260P-201
ENST00000362944
107 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
U8.6-201
ENST00000364939
135 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-1126P-201
ENST00000384002
107 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNA5SP134-201
ENST00000516492
96 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNA5SP395-201
ENST00000516567
118 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
MIR6755-201
ENST00000619993
66 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AL603908.1-201
ENST00000406098
201 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
COX7A2-206
ENST00000472311
325 nt
TSL 2
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
Y_RNA.173-201
ENST00000363776
113 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-815P-201
ENST00000384080
113 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
SNORD116-21-201
ENST00000384507
92 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AC073261.1-201
ENST00000429409
121 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
MIR5009-201
ENST00000578736
100 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
MIR6718-201
ENST00000616153
80 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
Y_RNA.563-201
ENST00000384707
108 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
MIR4694-201
ENST00000578534
80 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AC096720.1-201
ENST00000604441
183 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AC132825.6-201
ENST00000638861
357 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-832P-201
ENST00000363319
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-1099P-201
ENST00000363533
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-1327P-201
ENST00000365302
105 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
Y_RNA.377-201
ENST00000365644
108 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-243P-201
ENST00000391140
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-1254P-201
ENST00000391266
104 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AL161932.1-201
ENST00000437408
146 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AC108740.1-201
ENST00000498629
225 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
Y_RNA.659-201
ENST00000515994
113 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
MIR3613-201
ENST00000579844
87 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-1163P-201
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107 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-22P-201
ENST00000384355
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-1117P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-880P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
SNORD41.1-201
ENST00000391000
69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-269P-201
ENST00000391077
97 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-863P-201
ENST00000515989
104 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU7-13P-201
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62 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AL162376.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNY3P2-201
ENST00000362918
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BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
Y_RNA.281-201
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94 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
Y_RNA.323-201
ENST00000365157
109 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
AC109327.2-201
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378 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU7-129P-201
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62 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
RNU6-62P-201
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102 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
LMBR1-222
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TSL 5
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
SEPT4
O43236
MIR760-201
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BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1168P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1232P-201
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86 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
AC141557.1-201
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400 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
MIR3920-201
ENST00000581751
86 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU1-29P-201
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126 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
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TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
AC069113.3-201
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150 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-86P-201
ENST00000606534
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BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
HOTAIR_3.1-201
ENST00000611352
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BASIC
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SEPT4
O43236
SNORA70.25-201
ENST00000612741
95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1107P-201
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104 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
SNORA2A-201
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135 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1014P-201
ENST00000383940
103 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1144P-201
ENST00000384247
104 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-476P-201
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107 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
MIR181B2-201
ENST00000385004
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BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1154P-201
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104 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1265P-201
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103 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-412P-201
ENST00000516434
106 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNA5SP476-201
ENST00000516613
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNA5SP285-201
ENST00000516619
119 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNA5SP205-201
ENST00000364653
136 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1064P-201
ENST00000410626
104 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
MIR6129-201
ENST00000616087
109 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-957P-201
ENST00000363652
99 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-35P-201
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107 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNA5SP299-201
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116 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
MIR499B-201
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73 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
SNORA9.1-201
ENST00000362412
131 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1125P-201
ENST00000363601
107 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-1244P-201
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BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-480P-201
ENST00000384332
107 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
RNU6-313P-201
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BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
MIR5093-201
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100 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
KIF20B-201
ENST00000260753
6306 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
SEPT4
O43236
Y_RNA.78-201
ENST00000362970
110 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
SEPT4
O43236
AL606753.1-201
ENST00000427435
87 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
SEPT4
O43236
AL357793.1-201
ENST00000448412
401 nt
TSL 5
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
SEPT4
O43236
RNA5SP484-201
ENST00000458857
111 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
SEPT4
O43236
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
SEPT4
O43236
RNU6-479P-201
ENST00000516348
105 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
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