Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ZNF548Q8NEK5 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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ZNF548Q8NEK5 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZNF548Q8NEK5 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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