Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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USP53Q70EK8 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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USP53Q70EK8 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP53Q70EK8 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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USP53Q70EK8 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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USP53Q70EK8 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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USP53Q70EK8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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USP53Q70EK8 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP53Q70EK8 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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USP53Q70EK8 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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USP53Q70EK8 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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USP53Q70EK8 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
USP53Q70EK8 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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