Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TBR1Q16650 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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