Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CTF1Q16619 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CTF1Q16619 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CTF1Q16619 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.7 ms