Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DDB1Q16531 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DDB1Q16531 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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