Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNN3Q15417 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNN3Q15417 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CNN3Q15417 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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