Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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