Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNEQ04844 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHRNEQ04844 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHRNEQ04844 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.9 ms