Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1D1P20393 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
NR1D1P20393 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
NR1D1P20393 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.8 ms