Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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