Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
DSC3Q14574 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
DSC3Q14574 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
DSC3Q14574 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.2 ms