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Protein–RNA interactions for Protein: Q14563
SEMA3A, Semaphorin-3A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3A
Q14563
MIR489-201
ENST00000384923
84 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
RNA5SP237-201
ENST00000410414
113 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
RNU4-83P-201
ENST00000410863
133 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
AC022137.1-201
ENST00000483735
151 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
RNA5SP404-201
ENST00000517118
132 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
AC090897.1-201
ENST00000580909
226 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
AP000753.3-201
ENST00000604083
169 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
AC096720.1-201
ENST00000604441
183 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
AL157834.3-201
ENST00000615543
103 nt
BASIC
1.23
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.191-201
ENST00000363972
113 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
RNU6-787P-201
ENST00000384032
107 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.567-201
ENST00000384736
106 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
RNU6-1275P-201
ENST00000391087
107 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
RNU6ATAC41P-201
ENST00000408600
126 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
SPINT5P-201
ENST00000448174
155 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
OR2A41P-201
ENST00000473586
105 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
AC012676.2-201
ENST00000619258
186 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
AC025521.1-201
ENST00000621624
286 nt
BASIC
1.22
□□□□□ -2.21
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.98-201
ENST00000363109
102 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORD115-27-201
ENST00000364430
82 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-820P-201
ENST00000384273
107 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORA25-201
ENST00000384384
134 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNY1P4-201
ENST00000384595
115 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR181B2-201
ENST00000385004
89 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-1165P-201
ENST00000410119
107 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AC015818.7-201
ENST00000428754
109 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AC087499.7-201
ENST00000441958
109 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU7-62P-201
ENST00000458856
62 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
NMTRQ-TTG12-1-201
ENST00000467595
72 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
COX7A2-206
ENST00000472311
325 nt
TSL 2
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR4668-201
ENST00000582284
70 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR4439-201
ENST00000583746
80 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-90P-201
ENST00000606352
106 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AP001362.1-201
ENST00000625165
124 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
U6.109-201
ENST00000636749
87 nt
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
IL6ST-203
ENST00000381287
8667 nt
TSL 5
BASIC
1.21
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-228P-201
ENST00000362700
106 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.168-201
ENST00000363740
102 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU1-124P-201
ENST00000363861
145 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.224-201
ENST00000364308
111 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNY1P1-201
ENST00000364372
112 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.363-201
ENST00000365529
113 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORD12-201
ENST00000391002
90 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.620-201
ENST00000411009
88 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AL513043.2-201
ENST00000573941
143 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR4264-201
ENST00000583520
66 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AL353770.2-201
ENST00000620024
78 nt
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
CEP162-202
ENST00000403245
5156 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
LRRIQ1-202
ENST00000393217
5394 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.2
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
HSBP1P2-201
ENST00000299671
229 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNA5SP133-201
ENST00000363368
119 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNY1P2-201
ENST00000364820
117 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
TRAJ3-201
ENST00000390534
62 nt
APPRIS P1
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6ATAC8P-201
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126 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-447P-201
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104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-1118P-201
ENST00000410382
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-1076P-201
ENST00000410397
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-355P-201
ENST00000410427
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-791P-201
ENST00000410467
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-705P-201
ENST00000410601
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.609-201
ENST00000410669
89 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-1100P-201
ENST00000410691
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-860P-201
ENST00000410860
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-1217P-201
ENST00000411276
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-785P-201
ENST00000411324
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
BX276092.1-201
ENST00000427368
251 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU7-90P-201
ENST00000459216
62 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AC133485.1-201
ENST00000567176
124 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORA4-201
ENST00000584302
138 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR6078-201
ENST00000611069
100 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
U6.90-201
ENST00000614007
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
U6.70-201
ENST00000620287
104 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AC027335.2-201
ENST00000624030
375 nt
BASIC
1.19
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORD116-10-201
ENST00000363791
102 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-580P-201
ENST00000365159
107 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-979P-201
ENST00000383896
107 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORD116-22-201
ENST00000384430
92 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MT-TN-201
ENST00000387400
73 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.588-201
ENST00000391254
102 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNA5SP225-201
ENST00000410874
135 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNRPGP12-201
ENST00000449481
213 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORD79.1-201
ENST00000516069
84 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORA25.16-201
ENST00000516741
121 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MTND5P40-201
ENST00000559945
246 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR4500-201
ENST00000579472
76 nt
BASIC
1.18
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.119-201
ENST00000363301
96 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORA75.2-201
ENST00000391138
150 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
SNORA75.3-201
ENST00000391231
150 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU7-21P-201
ENST00000459430
62 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AP003327.1-201
ENST00000529684
127 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR4491-201
ENST00000581087
68 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR5588-201
ENST00000581890
63 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
IGLL4P-201
ENST00000614590
133 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
AC008163.1-202
ENST00000636004
2889 nt
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
ZGRF1-202
ENST00000309071
3347 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.17
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
MIR377-201
ENST00000362145
69 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-42P-201
ENST00000384165
107 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
SEMA3A
Q14563
RNU6-1124P-201
ENST00000384169
107 nt
BASIC
1.16
□□□□□ -2.22
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