Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SCN5AQ14524 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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