Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KLF9Q13886 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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