Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
DDX39BQ13838 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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