Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms