Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
STRN3Q13033 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
STRN3Q13033 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.6 ms