Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-2.92□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
POLR1AO95602 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
POLR1AO95602 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms