Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CITED1Q99966 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CITED1Q99966 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.4 ms