Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CSPP1Q1MSJ5 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CSPP1Q1MSJ5 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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