Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SSPNQ14714 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SSPNQ14714 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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