Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA3AQ14563 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA3AQ14563 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.5 ms