Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDE6HQ13956 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDE6HQ13956 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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