Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HDAC1Q13547 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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HDAC1Q13547 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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HDAC1Q13547 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HDAC1Q13547 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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